L‘industrialisation est récente bien que ses bases remontent au début du 20e siècle.

L’utilisation de la force hydraulique du Rhin et le projet du canal d’Alsace remontent à la veille de la première guerre mondiale. Après 1919, la France a la jouissance exclusive des eaux du fleuve et entreprend les premiers travaux d’aménagement (usine de Kembs en 1932). La construction de la centrale hydraulique de Fessenheim s’achève en 1956 et le Président de la République française M. René COTY l’inaugure le 8 juillet 1957.
Comportant quatre turbines verticales d’une puissance installée de 180 000 KVA sous une chute de 18,5 mètres, l'usine de Fessenheim est implantée sur un bief du canal d’Alsace, deux écluses de 185 mètres de long sont accessibles aux automoteurs de fort gabarit (1 350 tonnes).

En 1967, le site de Fessenheim est retenu pour l’installation d’une centrale thermique nucléaire, dont les deux tranches d’une puissance de 750 MW à l’origine sont portées à 950 MW en 1970. La technique américaine PWR est adoptée à la place de la filière française initialement prévue. Les travaux débutent en juin 1970, mobilisant des centaines d’ouvriers et de techniciens et se poursuivent malgré les manifestations des opposants au nucléaire. Fessenheim 1, première tranche de la centrale, est mise en service en mars 1977 et couplée sur le réseau national en août 1977. Site internet : www.edf.fr

Seul un embranchement particulier relie encore l’ancienne voie ferrée Mulhouse-Colmar par Neuf-Brisach aux sites industriels des centrales électriques.

La création d’une zone artisanale en bordure de l’agglomération, côté ouest vers Hirtzfelden, et d’une zone industrielle en bordure de la route longeant le canal d’Alsace (RD52) à l’est du village, permet la création et l’expansion d’un tissu de commerces, d’artisans, de T.P.E. et de P.M.E.

Le progrès économique a favorisé le développement de la vie associative dans la commune, notamment par la mise en place d’infrastructures socio-éducatives et sportives de qualité. Le pont transfrontalier sur le Rhin, construit par les collectivités locales (communauté de communes Essor du Rhin et communes badoises riveraines), inauguré par le Président de la République M. Jacques CHIRAC le 20 mai 2006, ouvre de nouvelles perspectives pour Fessenheim et son bassin de vie.